Mezquita antes que Iglesia, el templo es consagrado por el Arzobispo Jiménez de Rada el 22 de Junio de 1221. Planta basilical de tres naves, separadas por arcos de herradura califal sustentados por columnas con capiteles de origen visigodo. Alonso de Covarrubias es el maestro de la cúpula del abside y Diego de Velasco el autor del retablo. Los frescos de los muros, siglo XIII, poseen fuertes influencias románicas e hispano-árabes.

Hoy en día alberga el Museo de los Concilios y la Cultura Visigoda que contiene varias colecciones arqueológicas de los siglos VI, VII y VIII, que muestran algunos de los vestigios histórico-artísticos de lo que fue la antigua capital del reino visigodo de Toledo, tales como cimacios, capiteles, relieves, muestras epigráficas, pintura, documentos y orfebrería.